A Igreja Nossa Senhora da Luz de Morro de São Paulo, foi construída em várias etapas ao longo de muitos anos. A mudança da antiga capela que estava desabando situada ao lado do Farol para o centro da vila teve seu inicio em 1628. O seu termino foi no final do século 18, inicio do século 19. O nome da Igreja é uma homenagem a padroeira do local.Construída no estilo barroco, a Igreja de Morro de São Paulo teve em sua trajetória uma história rica com ouro, prata e imagens sacras. Foi alvo de muitos roubos e pirataria, tendo sido saqueada várias vezes. O último e maior de todos durou aproximadamente 8 anos, tendo inicio em 1996 e seu término em 2004. Praticamente todo o acervo foi roubado, haviam peças datadas em 1630 como uma coroa comprada em Portugal. O autor desses roubos foi nativo do local.
Considerada um patrimônio histórico, mas não tombada pelo Instituto do Patrimônio Histórico Artístico Nacional, a Igreja vai se deteriorando com o desgaste que o próprio tempo vem fazendo. As imagens e o altar feitos de madeira em seu estilo neoclássicos barroco foram destruídos pelos cupins, uma amostra do descaso por parte do governo e comunidade de Morro de São Paulo. Desde o ano de 2004 uma restauração começou a ser feita tanto no exterior como nas suas imagens sacras e instalações externas. O custo desta reforma é inteiramente doado por moradores e turistas que fazem suas doações para manter este belíssimo pedaço da história em pé.Uma curiosidade é que, se olharmos o chão da Igreja Nossa Senhora da Luz veremos várias lápides de antigos nativos e moradores que ali foram foram enterrados. A data mais antiga é de 1869.